2017 m. rugpjūčio 30 d. VMI viršininkas priėmė įsakymą Nr. VA-70, kuriuo pakeitė Mokesčio ir baudos už administracinį nusižengimą permokos (skirtumo) ar nepagrįstai išieškotų sumų grąžinimo (įskaitymo) taisykles, patvirtintas VMI viršininko 2004 m. gruodžio 7 d. įsakymu Nr. VA-186 (toliau – Taisyklės). Taisyklių pakeitimai įsigaliojo 2017 m. rugpjūčio 31 d.
Taisyklių 55 punktas papildytas nauju 3 papunkčiu, numatančiu, kad mokestinio patikrinimo metu mokesčio ir (arba) baudos už administracinį nusižengimą permoka gali būti grąžinta (įskaityta) nelaukiant mokestinio patikrinimo pabaigos, jeigu mokestinis patikrinimas yra sustabdytas, o dėl prašomos grąžinti (įskaityti) permokos ar baudos mokesčių administratoriui nekyla pagrįstų abejonių. Kitaip tariant, mokestinio patikrinimo metu gali būti grąžinta (įskaityta) ta permokos ar baudos dalis, dėl kurios iš esmės nekyla ginčo.